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水稻種質資源庫具備智能控制功能，包含了制冷除濕系統、圍護結構、中央控制系統、手機客戶端管理系統、保溫隔離系統、視頻監控系統、智能展示系統、種質資源存貯架等；可實現多種形式數據監管，查看實時數據、歷史曲線、報警記錄、各種數據報表等；異常報警情況可通過短信、郵件、手機APP信息推送給用戶，聲光報警也可及時提醒管理人員采取措施。種質庫斷電后，來電時可自動恢復運行，充分保證試驗工作的連續性。
1、保藏管理：記錄育種資源入庫的時間和數量、設置預警提醒等相關信息；根據出入庫操作，系統實時更新數據；并提供庫存核對、檢驗檢測功能，實現育種資源動態管理。
2、種質信息管理：綜合管理育種資源的表型性狀、基因等相關信息和圖片，可對種質基本信息和性狀數據進行多條件檢索，查找需要的資源。
3、預警提醒：對儲存期到期、庫存量低于預設值、發芽率低于預設值、達到庫存核對時間的種子進行自動提醒，防止種子生活力喪失以及庫存不足。
4、設備管理：根據實際需要添加、刪除、修改育種資源實體儲藏庫設備。
如果沒有專業的貯存設施，水稻種質資源便只能保存在普通的室溫干燥器、冰柜等設備中。這種貯存方式，使得水稻種質保存壽命短，面臨活力快速喪失的風險。因此，水稻種質資源庫的建成對其種質的收集、保存、創新與共享利用具有重要意義，同時也可為選育高產優質水稻新品種、保障糧食安全提供技術支撐。
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